Vòng đấu cuối của bảng B được dự báo sẽ rất quyết liệt, khi cả 4 đội bóng của bảng đấu này đều đang cùng 3 điểm. Đặc biệt, cuộc đối đầu giữa hai đội cuối bảng là TP.HCM - Đồng Nai lại có phần hấp dẫn hơn. Theo đó, các cầu thủ trẻ TP.HCM chơi có phần lấn lướt, nhưng phút 31, đội bóng trẻ Đồng Nai đã bất ngờ có bàn mở tỷ số do công của Khánh Hoà, dù họ không nắm thế trận và cũng không nhiều cơ hội để ăn bàn.

Bàn thua khiến CLB TP.HCM choáng váng, nên buộc phải đẩy cao đội hình nhằm tạo sức ép trên phần sân của Đồng Nai để tìm bàn gỡ. Mãi đến phút 44, Quang Khôi – con trai của cựu tuyển thủ Nguyễn Quang Hải - mới có bàn cân bằng 1-1 cho đội bóng trẻ TP.HCM từ pha đá bồi rất hiểm hóc. Đầu hiệp 2, đội bóng trẻ TP.HCM đã có bàn nâng tỷ số lên 2-1 và người lập công lại là Quang Khôi. 

Ở chiều ngược lại, Đồng Nai cũng muốn đẩy cao đội hình để tìm bàn gỡ, nhưng hàng thủ chắc chắn của TP.HCM vẫn không để họ làm được điều ấy. Với chiến thắng chung cuộc 2-1, đội bóng trẻ TP.HCM đã giành vé đầu tiên vào tứ kết khi đứng đầu bảng B với 6 điểm, trong lúc Đồng Nai bị loại do đứng chót bảng.

Ngược lại, trận đấu giữa SLNA – PVF-CAND khá trầm, dẫu cả hai đều là lò đào tạo trẻ tên tuổi. Hiệp 1 kết thúc, nhưng không có bàn thắng nào được ghi. Thế trận trong hiệp 2 cũng không nhiều thay đổi, khi cả hai đội vẫn chơi chậm rãi và chung cuộc hoà 0-0. Với trận hoà này, SLNA và PVF-CAND cùng nắm tay nhau vào tứ kết khi là đội nhì bảng B và đội thứ 3 có thành tích tốt nhất.

Ở bảng C, do Hà Nội đã sớm giành vé vào tứ kết, nên cuộc đối đầu giữa họ và Đồng Tháp được nhận định là thế trận một chiều. Ở đó, Đồng Tháp buộc phải có điểm để nuôi hy vọng. Tuy nhiên, với sự vượt trội, đội bóng trẻ Hà Nội đã không cho Đồng Tháp có cơ hội làm khó khung thành của họ. Mãi đến phút 28, Phi Hùng mới có bàn mở tỷ số cho Hà Nội. Sau đó 3 phút, đến lượt Mạnh Quân nâng tỷ số lên 2-0 cho Hà Nội.

Sang hiệp 2, Hà Nội vẫn là những người nắm thế chủ động, khiến khung thành của đội bóng Tháp Mười gặp không ít khó khăn. Mãi đến phút 75, Mạnh Quân đã có cú đúp nâng tỷ số lên 3-0, qua đó đóng lại cánh cửa vào tứ kết của Đồng Tháp. Những phút sau đó, Quốc Trung dù có bàn rút ngắn tỷ số 1-3 cho Đồng Tháp, nhưng họ cũng chỉ làm được đến thế. Ở phút 88, Hà Nội chỉ còn chơi với 10 người khi cầu thủ Lâm Tấn phải nhận thể đỏ trực tiếp. Dẫu vậy với chiến thắng chung cuộc 3-1, Hà Nội đã đứng đầu bảng C với 3 trận toàn thắng.

Trận còn lại giữa Lâm Đồng - Huế cũng diễn ra khá hấp dẫn, khi đội bóng trẻ cố đô đang quyết phải thắng để có thể giành vé đi tiếp. Rất nhiều cơ hội được cầu thủ Huế tạo ra, nhưng bàn thắng vẫn chưa đến. Mãi đến phút 52, Huế mới có được bàn mở tỷ số và người lập công là Đức Trí. Sau đó ở phút 70, Anh Kỳ đã có bàn nâng tỷ số 2-0 cho Huế. Với trận thắng này, Huế đã giành vé vào bán kết khi xếp nhì bảng C.

8 đội bóng lọt vào tứ kết 

Thể Công, PVF (bảng A); TP.HCM, SLNA (bảng B); Hà Nội, Huế (bảng C): cùng Đà Nẵng và PVF-CAND do là 2 đội xếp thứ 3 có thành tích tốt nhất.