Khi Amorim đến MU, dường như Marcus Rashford sẽ tỏa sáng dưới sự dẫn dắt của ông. Tiền đạo người Anh đã ghi 3 bàn thắng trong 2 trận đấu đầu tiên, nhưng sau đó phong độ sa sút nghiêm trọng. Amorim bắt đầu đặt câu hỏi về tính chuyên nghiệp của Rashford, khi có thông tin cho rằng Rashford đã đi chơi đêm hai ngày trước trận derby Manchester.

Đỉnh điểm của mâu thuẫn là vào đầu năm 2025, Amorim đã công khai chỉ trích tiền đạo này. Không lâu sau, Rashford được cho mượn tại Aston Villa và khi trở lại vào mùa hè, sự bất hòa này vẫn còn dai dẳng. Amorim từ chối đưa anh trở lại đội hình Man United và Rashford lại bị đẩy sang cho Barca mượn.

Một vụ bất hòa nổi tiếng khác liên quan đến Amorim xoay quanh Alejandro Garnacho. Tiền đạo người Argentina từng được đồn đoán sẽ rời MU, nhưng mọi chuyện trở nên căng thẳng trong giai đoạn cuối chiến dịch Europa League của MU vào giữa năm 2025. Amorim đã công khai chỉ trích Garnacho vì pha bỏ lỡ của anh trong trận bán kết gặp Bilbao, và ông quyết định loại cầu thủ này khỏi đội hình trong trận thua 0-1 trước Tottenham ở trận chung kết.

Giờ đây, Garnacho đang thi đấu cho Chelsea và thậm chí còn thích một bài đăng trên mạng xã hội đưa tin về việc Amorim bị sa thải.

Jadon Sancho đã có những bất đồng với Erik ten Hag trước khi Amorim đến, nhưng tình hình của anh không khá hơn dưới thời HLV người Bồ Đào Nha. Amorim từng nói toạc ra Sancho không được ra sân vì không thực sự tận tâm. Amorim được cho là đã nói với ban lãnh đạo của MU rằng sẽ tốt hơn cho tất cả mọi người nếu Sancho ra đi. Mặc dù Sancho rời đi đến Aston Villa vào tháng 9 năm ngoái, nhưng cả hai vẫn tiếp tục xung đột sau đó.

Ngay sau khi lên nắm quyền, rõ ràng là Amorim không đánh giá cao tiền vệ người Brazil. Antony được cho mượn đến Real Betis vào tháng 1 năm 2025. Khi được hỏi lý do, Amorim nói thẳng thắn: "Để chơi trong hệ thống này, bạn cần một mức độ thể lực mà Jadon Sancho và Antony hiện đang gặp khó khăn trong việc tìm kiếm”. Và vào mùa hè năm 2025, Antony bị đẩy xuống tập cùng biệt đội “bom xịt”  như Sancho và Rashford.

Man United đã ký hợp đồng với Rasmus Hojlund dưới thời Ten Hag và khi Amorim đến, Hojlund không còn được coi là tiền đạo số 1 của MU. Hojlund đã chuyển đến Napoli theo dạng cho mượn, kèm theo điều khoản mua đứt vào mùa Hè năm ngoái.

Chính từ đây, mối quan hệ giữa hai người ngày càng trở nên rạn nứt. Amorim từng ám chỉ Hojlund là tiền đạo chỉ biết chờ bóng. Còn Hojlund đã không ít lần mỉa mai Amorim trên mạng xã hội. Hojlund từng chú thích một bài đăng về việc anh ăn mừng bàn thắng ghi được cho Napoli: "Suy nghĩ đủ nhanh cho ông chưa?".

Dưới thời Amorim, Kobbie Mainoo hầu như không được ra sân mùa này, chỉ đá chính một trận duy nhất gặp Grimsby Town ở League Cup. Điều này là một sự thay đổi hoàn toàn so với phong độ xuất sắc mà anh thể hiện cho ĐT Anh tại EURO 2024, cũng như việc ghi bàn thắng quyết định giúp MU vô địch FA Cup dưới thời Ten Hag. Đáng nói, Amorim đã gây bất hòa khi chê bai Kobbie Mainoo thiếu tốc độ để chơi trong sơ đồ 3-4-3 yêu thích của mình.